La controverse porte sur les moyens susceptibles d'enrayer la menace pesant sur le thon rouge, et plus particulièrement les quotas. 

            De manière très globale, on perçoit facilement l'enjeu majeur : certes, le thon est en voie d'extinction mais la rentabilité à court-terme de sa pêche est un argument économique nuançant toute mesure « trop écologiste ». Qui plus est, certaines variables (populations de thons rouges, quantités pêchées illégalement) sont loin d'être faciles à déterminer. Dès lors, il est difficile de déterminer des quotas idéaux. Enfin, nous avons du prendre en compte des aspects politiques et stratégiques au cours de cette controverse : les enjeux économiques concernant le marché du thon rouge sont tels que des conflits d'intérêts perturbent l'application de toute politique de pêche durable. Telles sont finalement les considérations scientifiques, écologiques, politiques et économiques de la controverse dont nous avons eu le souci.