Créé par un décret du Président de la République Albert Lebrun, en1939, le C.N.R.S. a pour vocation, à cette époque, de regrouper tous les organismes d'État, non spécialisés, de recherche fondamentale ou appliquée ainsi que de coordonner les recherches à l'échelon national. Dans le contexte de la deuxième guerre mondiale, il est initialement orienté vers l'armement. Le C.N.R.S. s'oriente à la fin de celle-ci vers la recherche fondamentale. 1966 est pour le C.N.R.S. une date importante car elle marque le début de l'association de ses recherches avec celles de l'Université.

Tout comme l'Institut National de Recherche Agronomique (I.N.R.A.), le C.N.R.S., qui est un Institut de recherche publique, apporte un éclairement scientifique et expérimental sur l'affaire Gaucho. Il fait notamment partie du Comité Scientifique et Technique, qui rend un avis important en 2003, à la fin de l'Etude Multifactorielle Epidémiologique.